Publications

(2021). Молекулярное моделирование кинетики ингибирования фермента KRAS с онкогенной мутацией G12C соединением ARS-853. XXVII СИМПОЗИУМ “БИОИНФОРМАТИКА И КОМПЬЮТЕРНОЕ КОНСТРУИРОВАНИЕ ЛЕКАРСТВ”. Сборник научных трудов.

Cite DOI

(2021). Компьютерное моделирование молекулярных процессов с участием компонентов вируса SARS-CoV-2. XXVII СИМПОЗИУМ “БИОИНФОРМАТИКА И КОМПЬЮТЕРНОЕ КОНСТРУИРОВАНИЕ ЛЕКАРСТВ”. Сборник научных трудов.

Cite DOI

(2021). Бороновые кислоты как ингибирующие агенты металло-В-лактамазы NDM-1. XXVII СИМПОЗИУМ “БИОИНФОРМАТИКА И КОМПЬЮТЕРНОЕ КОНСТРУИРОВАНИЕ ЛЕКАРСТВ”. Сборник научных трудов.

Cite DOI

(2020). Расчет эффективных кинетических параметров на основании молекулярного моделирования механизмов химических реакций. Математика и математическое моделирование. Сборник материалов XIV Всероссийской молодежной научно-инновационной школы.

Cite

(2020). Молекулярное моделирование динамики фоторегулируемой аденилатциклазы. МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. XXVII международная конференция / R&G Dynamics Москва. Ижевск Москва Ижевск / Тезисы / 2020г. / том 27 / тезисы.

Cite

(2020). База данных "Интермедиаты химических реакций в активных центрах белков". XXVII Международная конференция “Математика. Компьютер. Образование” (МКО-2020).

Cite

(2019). Ферментативные реакции: от молекулярного моделирования до стационарной кинетики Михаэлиса-Ментен. XXXVI Всероссийский симпозиум молодых ученых по химической кинетике. Сборник трудов. Под редакцией Мельникова М.Я., Верной О.И.

Cite

(2019). Разработка интерфейса для расчетов методом молекулярной динамики с потенциалами КМ/ММ. Книга тезисов “1ая Конференция с международным участием “Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента”".

Cite

(2019). Применение электронных дескрипторов межатомных взаимодействий для детализации механизмов ферментативных реакций. Книга тезисов “1ая Конференция с международным участием “Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента”".

Cite

(2019). От молекулярного моделирования механизмов ферментативных реакций до стационарной кинетики Михаэлиса-Ментен. Сборник тезисов Всероссийская конференция “Взаимосвязь ионных и ковалентных взаимодействий в дизайне молекулярных и наноразмерных химических систем”.

Cite

(2019). Определение констант связывания соединений семейства ARS с белком KRASG12C методом молекулярного докинга. Труды XIX Ежегодной молодежной конференции с международным участием ИБХФ РАН-ВУЗЫ “БИОХИМИЧЕСКАЯ ФИЗИКА”, III симпозиума “СОВРЕМЕННОЕ МАТЕРИАЛОВЕДЕНИЕ”,.

Cite

(2019). Молекулярное моделирование химических реакций с участием цистеина в белковых молекулах. Труды XIX Ежегодной молодежной конференции с международным участием ИБХФ РАН-ВУЗЫ “БИОХИМИЧЕСКАЯ ФИЗИКА”, III симпозиума “СОВРЕМЕННОЕ МАТЕРИАЛОВЕДЕНИЕ”,.

Cite

(2019). Молекулярное моделирование флуоресцентных белков: от квантовой химии хромофоров до динамики макромолекул. Книга тезисов “1ая Конференция с международным участием “Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента”".

Cite

(2019). Молекулярное моделирование новых форм белка iLOV с измененными спектральными свойствами. Книга тезисов “1ая Конференция с международным участием “Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента”".

Cite

(2019). Молекулярное моделирование механизма передачи сигнала от фоторецепторного домена к каталитическому в белковом комплексе bPAC. Сборник тезисов Всероссийская конференция “Взаимосвязь ионных и ковалентных взаимодействий в дизайне молекулярных и наноразмерных химических систем”.

Cite

(2019). Молекулярное моделирование ковалентного связывания биливердина в белке miRFP670. Книга тезисов “1ая Конференция с международным участием “Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента”".

Cite

(2019). Молекулярное моделирование кинетики ковалентного связывания ARS-853 с ферментом KRASG12C. XXXVI Всероссийский симпозиум молодых ученых по химической кинетике. Сборник трудов. Под редакцией Мельникова М.Я., Верной О.И.

Cite

(2019). Влияние электронной делокализации на процесс переноса протона лимитирующей стадии реакции гидролиза цефалоспоринов металло-β-лактамазой. Книга тезисов “1ая Конференция с международным участием “Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента”".

Cite

(2019). Towards deep insight into the cephalosporin hydrolysis in the active site of metallo-beta-lactamase. Abstracts of 12th International conference BIOCATALYSIS-2019: Fundamentals and Applications / Editor V. Tishkov - Moscow.

Cite

(2019). BORN-OPPENHEIMER AND QM/MM MOLECULAR DYNAMICS OF CATIONS BINDING IN SOLUTIONS. ХХI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry. Book of abstracts in 6 volumes.

Cite

(2018). Электронные факторы, определяющие каталитические константы гидролиза цефалоспориновых антибиотиков металло-β-лактамазой. Образование и наука для устойчивого развития. X научно-практическая конференция. Материалы конференции. Часть I. Проблемы окружающей среды и зеленая химия для устойчивого развития.

Cite

(2018). Молекулярное моделирование мутантов флуоресцентного белка iLOV с модифицированным хромофором. Биохимическая физика: труды XVIII Ежегодной молодежной конференции с международным участием ИБХФ РАН-ВУЗы.

Cite

(2018). Молекулярное моделирование механизмов регуляции ферментативной активности hAsp. МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. тезисы XXV международной конференции.

Cite

(2018). Методы молекулярного моделирования и современная кристаллохимия: комплементарность и синергия. IX Национальная кристаллохимическая конференция. Программа и тезисы. Суздаль, 4 - 8 июня 2018 г.

Cite

(2018). Ковалентные ингибиторы белка RAS. Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул. Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod-2018 (Новосибирск, 28–30 апреля 2018 г.).

Cite

(2018). Использование метода DFTB для исследования структуры красных флуоресцентных белков mKeima и eqFP670. Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул. Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod-2018 (Новосибирск, 28–30 апреля 2018 г.).

Cite

(2018). The Parallel Hydrodynamic Code for Astrophysical Flow with Stellar Equations of State. Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (24-25 сентября 2018 г., г. Москва).

Cite

(2018). The origin of the calexarene selectivity to cesium cation from the Born-Oppenheimer molecular dynamic simulationss. Third International School-Seminar “From Empirical to Predictive chemistry” (E2PC2018).

Cite

(2018). Bridging the gap: combining the QM/MM and QTAIM in search of dominating interactions in biological systems. Third International School-Seminar “From Empirical to Predictive Chemistry” (April 5-7, 2018, Kazan, Russia): book of abstracts / ed. T.I. Madzhidov, V.A. Afonina, I.S. Antipin.

Cite

(2018). Born-Oppenheimer molecular dynamics reveals the origin of calixarene selectivity to cesium cations. Школа-конференция Атомистическое моделирование функциональных материалов ASFM2018.

Cite

(2018). A step to predictive structural biochemistry: QM/MM & QTAIM approach. International Workshop on Chemical Crystallography and Structural Biology “The Second Struchkov Meeting”.

Cite

(2017). Зеленый флуоресцентный белок: от рождения до смерти. Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности / Под редакцией: академика В.А. Садовничего, академика Г.И. Савина, чл.-корр. РАН Вл.В. Воеводина.

Cite

(2017). QM-MM описание каталитических циклов в ферментативном катализе. IIX Международный конгресс “Биотехнологии: состояние и перспективы развития” Москва, 20-22 февраля 2017.

Cite

(2017). Power Measurements of Hartree-Fock Algorithms Using Different Storage Devices. 2017 IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW).

Cite DOI

(2017). Molecular modeling approach to understand the activity control mechanisms of hAsp. Biocatalysis-2017: Abstracts of 11th International Conference “Biocatalysis: Fundamentals and Applications” / Editors V. Tishkov and V. Fedorchuk.

Cite

(2017). Molecular mechanism of antibiotics hydrolysis by metallo-beta-lactamase. 11th International Conference “Biocatalysis-2017”.

Cite

(2017). Computational modeling of molecular processes in proteins. WATOC 2017 11th Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists, Munich, Germany, 27 August – 1 September 2017.

Cite

(2016). Молекулярная динамика в задачах ферментативного катализа. // Сборник тезисов XXXIV Всероссийского симпозиума молодых ученых по химической кинетике, 14-17 ноября 2016 г. Московская обл., пансионат “Берёзки”.

Cite

(2016). Моделирование поглощения светособирающей антенны Thermochromatium tepidum. Современная химическая физика. XXVIII. Симпозиум. 19-30 сентября 2016 г. г. Туапсе. Сборник тезисов.

Cite

(2016). Моделирование влияния растворителя на каталитические способности матричной металлопротеиназы ММР-2. XVI Ежегодная международная молодежная конференция ИБХФ РАН ВУЗЫ “Биохимическая физика”.

Cite

(2016). Компьютерное моделирование полного каталитического цикла Аспартоацилазы. Сборник тезисов докладов конференции “Физико-химия наноструктурированных катализаторов”.

Cite

(2016). Квантовая химия флавин-содержащих белков. Современная химическая физика. XXVIII. Симпозиум. 19-30 сентября 2016 г. г. Туапсе. Сборник тезисов.

Cite

(2016). High temperature coolant demonstrated for a computational cluster. 2016 International Conference on High Performance Computing and Simulation, HPCS 2016.

Cite DOI

(2009). Суперкомпьютеры и квантовая биохимия. Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности / Под редакцией: академика В.А. Садовничего, академика Г.И. Савина, чл.-корр. РАН Вл.В. Воеводина.

Cite

(2009). Theoretical Characterization of Bathorhodopsin. MOLECULAR SIMULATION IN MATERIAL AND BIOLOGICAL RESEARCH.

Cite